Institut Agama Islam Negeri Kudus merupakan Perguruan Tinggi Islam Negeri yang terus berkomitmen dalam peningkatan kualitas baik dalam segi mutu akademik maupun pelayanan administrasi bagi civitas akademik itu sendiri. Berdasarkan komitmen tersebut, sudah seyogyanya Institut Agama Islam Negeri Kudus mengembangkan sistem penjaminan mutu dan melakukan pengendalian internal dengan melaksanakan audit mutu akademik. Terkait dengan peningkatan mutu input, proses dan output pendidikan serta pengembangan sistem penjaminan mutu akademik di IAIN Kudus, maka diperlukan suatu audit mutu internal baik pada level Institut, Fakultas mapun pada level Prodi. Kegiatan audit mutu internal merupakan salah satu bentuk monitoring dan evaluasi yang dilakukan terhadap capaian maupun target-target yang telah ditetapkan, sekaligus sebagai upaya tercapainya target penilaian akreditasi yang diharapkan.Adapun sasaran dari program kerja ini adalah meningkatnya mutu akademik dan adanya penjaminan mutu serta tercapainya target nilai akreditasi yang maksimal, baik akreditasi Institusi maupun akreditasi prodi.

Tujuan Pemeriksaan dari kegiatan ini adalah  meneliti kepatuhan/ketaatan penjaminan mutu internal tingkat Prodi Magister PGMI terhadap kebijakan akademik, standar dan sasaran mutu, manual mutu internal, meneliti kesesuaian arah dan pelaksanaan penjaminan mutu akademik internal tingkat Prodi Magister PGMI terhadap kebijakan akademik, standar dan sasaranmutu, dan manual mutu internal tingkat Institusi serta meneliti kepastiancapaian mutu pada setiap kriteria. Sasaran Pemeriksaan yaitu keandalan sistem pengendalian internal atas administrasi bidang akademik pada Prodi Magister PGMI di lingkungan IAIN Kudus. Periode yang diperiksa yaitu capaian mutu pada tahun akademik 2022/2023. Pelaksanaan kegiatan audit dimulai dari persiapan administrasi yang dilakukan oleh Lembaga Penjaminan Mutu IAIN Kudus. Tim auditor kemudian melakukan identifikasi dan analisis terhadap hasil temuan Desk Evaluation, visitasi, menyusun rekomendasi hingga penyusunan laporan. Audit Lapangan dilaksanakan pada tanggal 28 - 31 Agustus 2023 di Prodi Magister PGMI. Tahap selanjutnya dilakukan FGD/RTM yang berisi paparan hasil AMI dihadapan para pimpinan. Hasil rekomendasi ditindak lanjuti oleh pihak yang bertanggung jawab, dan untuk memastikan pelaksanaan tindaklanjut, tim LPM melakukan Monitoring dan evaluasi tindaklanjut. Kegiatan tersebut diketuai oleh Elya Umi Hanik, M.Pd.I